در اين مراسم كه با حضور دكتر فاطمه نيري رئيس دانشكده پزشكي، دكتر جعفريان مشاور رئيس دانشگاه و عضو هيات علمي دانشگاه، دكتر ظفرقندي عضو هيئت علمي و استاد دانشگاه و دكتر عمادي معاون آموزشي و دانشجويان ورودي سال 85 مورخ 4/7/89 در تالار ابن سينا برگزار شد، متن مناجاتنامه پزشكي توسط يكي از دانشجويان اين دوره به شرح ذيل قرائت شد.
بنام خدا
پروردگارا؛ از اينكه در پر‌تو لطف عميم و مهر ويژه تو جامه پزشكي به بركرده و بار سنگين اين امانت را بر دوش گرفته ام به همان زبان كه خاكسارانه ثنا و سپاس تو مي گويم به نجواي بي نياز خويش با تو مي پردازم و دست مدد جويي به سوي تو دادار بي نياز دراز مي كنم و ترا به مقام بي چوني و بزرگيت سوگند مي دهم كه دمي مرا به خويشتنم وا منهي كه سخت از لغزش در ميدان آزمونهاي پياپي و كژراهي به بيراهه گمراهي و غفلت و غرور و خود برتر بيني بيمناك و از ناپايداري عمر و درازي آروزها و كاستي هاي سرشتي خويش نگران و در هراسم.
 شفا بخشا  تو دانش پزشكي را واسطه تحقق اراده خويش در شفاي بيماران و جلوه اي از رافت ربوبي در تسكين آلام دردمندان قرار داده اي تا به تلاش پژوهشگران پويا و پزشكان انديشمند، همواره درهاي تازه اي از رحمت بيكران تو به روي همگان گشورده شود توفيق و تواني ده كه پاس حرمت پزشكي را بدارم و به دور از هر شائبه اي، خوشتن را در جايگاه بيمار دردمند ببينم و نسبت به همه بندگان تو از فقير و غني، آشنا و بيگانه، همكيش و ناهمراه احساس همانندي و همدردي انجام وظيفه كنم كه رضاي تورا با خدمت شايسته، استوار و سنجيده نسبت به بندگان گوناگون تو همسويافته ام.
مهربانا؛ به ما آموختي كه عاطفت و مهرباني نسبت به آفريدگانت را فرا گير سازيم و نازيبائي ها را از مردم بپوشيم و راز آنان با كس نگوئيم و پيوسته خيرخواه خلق باشيم و خرقه خودبيني و زياده طلبي از تن درآريم و زنجير شيفتگي دنيا و بستگي دل به مال و مقام و زينت ناپايدار جهان بگسليم و همواره پايش نفس سركش و آزمند به نافرماني راپيشه سازيم و اين بر ما بسي دشوار است از آنروي نيازمندانه و مدد خواهانه چشم به امداد خود دوخته اند مپسند كه نگاه اميد من از ملكوت قدس خود نواميد بازگردد و رشته اي كه دلم را به گنجينه اميد تو پيوند مي دهد گسسته شود.
پروردگارا تو خود به اجابت دعاي بندگان نويد و وعده داده ايد‌اي دوخته ام اي آنكه تو آنگونه اي كه من دوست دارم، مرا آنگونه گردان كه تو دوست داري.
آمين يارب العالمين