صبح روز پنج شنبه، هشتم خردادماه سال 93 پيكر استاد شمس شريعت تربقان در ميان اشك و ماتم جمع زيادي از اعضاي خانواده بزرگ دانشگاه در مجتمع بيمارستاني امام خميني (ره) تشييع شد، اين مراسم با حضور دكتر جعفريان، رييس دانشگاه، دكتر لاريجاني و دكتر ظفرقندي، روساي پيشين دانشگاه،اساتيد پيشكسوت، كاركنان، دانشجويان دانشگاه و خانواده آن مرحوم برگزار شد.
پس از برگزاري مراسم تشييع پيكر استاد شمس شريعت تربقان در مجتمع بيمارستاني امام خميني (ره)، اين استاد گرانقدر در قطعه 312 بهشت زهرا به خاك سپرده شد.
دكتر مسلم بهادري رئيس دفتر ارتباط با دانش آموختگان دانشگاه علوم پزشكي تهران در حاشيه مراسم تشيع پيكر دكتر شمس شريعت با اشاره به اينكه درگذشت استاد فقيد دكتر شمس شريعت تربقان را به خانواده بزرگ دانشگاه علوم پزشكي تسليت مي گويم؛ اظهار داشت: از بدو ورود ايشان تا همين امروز، از دكتر شريعت خاطرات بسيار شيريني به يادگار در ذهنم دارم. 
وي افزود: ايشان درس آسيب شناسي تدريس ميكرد و يكي از مرتب ترين اساتيدي بود كه در كلاسها حضور فعال داشتند و تمام ساعت را با انرژي در خدمت دانشجويان ميگذرانند، در آن زمان كه مسئول آموزش گروه بودم خيلي از دكتر شريعت راضي بودم و ايشان از اساتيد بسيار با اخلاق دانشگاه بودند. 
رئيس دفتر ارتباط با دانش آموختگان دانشگاه در ادامه خاطر نشان كرد: دكتر شمس شريعت يك انسان متعهد به تمام معنا،مسلمان و معتقد بود.
دكتر بهادري با اشاره به لزوم تعهد اخلاق حرفه اي پزشكي؛ تاكيد كرد: دكتر شريعت به اخلاق حرفه اي پزشكي متعهد و ملتزم بود و اعتقاد قلبي داشت و هميشه به شاگردانش اخلاق ياد ميداد و توصيه ميكرد. 
وي همچنين از آن مرحوم به عنوان دوست و همكار قديمي ياد كرد و افزود: بيش از 55 سال است كه من با اين استاد فقيد همكار بودم و خاطرات بسياري از ايشان دارم كه نه تكرار شدني هستند و نه فراموش شدني.
دكتر بهادري، فقدان اين استاد و دانش آموخته پيشكسوت دانشگاه را كه هميشه خواهان حفظ تاريخچه دانشگاه و احتساب سالهاي فعاليت مدرسه طب در تربيت دانشجويان پزشكي بود را غير قابل تصور خواند و تاكيد كرد: نسل جوان دانش آموختگان دانشگاه بايد احساس تعلق و تعهدي همچون آن زنده ياد داشته باشند.